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染色質開放性是指真核生物染色質和組蛋白、轉錄因子等是否結合的開放程度，這一特性與染色質轉錄活躍程度相關，從而能夠揭示基因調控的機制。ATAC-seq測序與分析，即利用轉座酶研究染色質可接近性的高通量測序，可以檢測染色質開放區域，其原理是通過轉座酶Tn5容易結合在開放染色質區域的特性，對Tn5酶捕獲到的DNA序列進行測序和富集分析。
ChIP-Seq測序與分析 是指通過染色質免疫共沉淀技術特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，并對其進行純化和文庫構建；然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序，通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區段信息，是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段，為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。
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